随着细菌的繁殖导致胎儿的死亡，进而出现流产。此外，如果存在一个感染的环境但不是直接感染胎儿也有可能发生流产。

　　布鲁氏菌 发生布鲁氏菌的区域将会给奶牛场的繁殖产生重要的影响。布鲁氏菌病是人畜共患的慢性传染病，奶牛对布鲁氏菌最为敏感，患病牛的临床主要特征就是流产或早产，流产可发生于妊娠的任何时期，但多发生于妊娠后5个月~8个月，并常引起子宫炎。

　　李斯特杆菌 李斯特杆菌能导致流产，李斯特杆菌能在青贮料、干草及土壤中长期存活。由李斯特杆菌导致的流产初期大概一周会出现几例，大部分流产发生在怀孕3个月左右。这些胎儿通常已经发生了自溶，这时的胎儿所含的细菌可能成为牛群多种类型流产的最普遍的诱因，而母牛在此以后能出现抗感染能力。

　　大肠杆菌 埃希氏大肠杆菌所引起的急性乳房炎会导致大量的内毒素在乳房和血液里释放。奶牛临床上主要表现为精神萎靡，瘤胃蠕动减弱和高体温。危害主要在于内毒素作用机体后，引起奶牛体内前列腺素和其他激素的释放，从而引起奶牛流产。

　　引起流产的病毒性因素

　　病毒性腹泻病毒（BVD）奶牛病毒性腹泻能引起全身性症状。病毒通过循环到达胎盘中成长的胎儿，可引发早期胚胎的死亡和流产。如果没有出现流产可能就会出现木乃伊胎。患病动物和带毒动物是本病的主要传染源。国外本病发生较多。

　　牛传染性鼻气管炎病毒（IBR）牛传染性鼻气管炎是一种高度传染性的疱疹病毒疾病，能引起一系列不同的疾病症候群，最常见的表现为呼吸性疾病（如肺炎、“红鼻子病”），也是引起奶牛流产原因诊断中最常见的疾病。所引起的流产通常发生在怀孕的第4个月以后，病毒在牛群中扩散后几周内也可以发生。

　　赤羽病病毒（AKV）又叫阿卡斑病，该病以流产、早产、死胎、畸形、新生胎儿发生关节弯曲、积水性无脑症和流行性暂时热为特征。主要由吸血昆虫传播。一般8月份母牛异常产逐渐增多，10月份达到高峰，也可逐渐持续到次年3月，一群牛临床症状主要依次表现为早期流产、胎儿体形异常、大脑缺损，其中死亡的病例多发生于流行初期。

　　霉菌和寄生虫霉菌

　　霉菌能导致奶牛的流产，占整个流产的比例为10%~20%，可在怀孕60天左右出现流产，但主要集中在孕期最后两个月。通常发生在冬春季，奶牛经常是被限制在一定范围中而接触到发霉的干草和青贮饲料，一般认为霉菌是通过血液循环到达胎盘和胎儿。临床上流产严重者会转变成肺炎。